压力与焦虑研究
斑马鱼为恐惧和焦虑相关疾病的研究提供了一个很好的模型。 新颖而又有效的测试是新型水箱潜水测试。 由于斑马鱼被放置在新颖的环境中，因此通常首先将它们放在底部。 他们越勇敢，就会越早开始探索水箱的上半部分，并在那里花费更多的时间。
水平和垂直行为
在斑马鱼潜底实验中，潜底行为和游动到上层水域的时间是评价压力和焦虑的重要指标，也是抗焦虑药或致焦虑物质效果评价的重要参数。侧视图跟踪室测量斑马鱼潜底行为参数的实用方法。
另一个实验范例是旷场实验，类似于啮齿动物研究，可以测试出鱼类的趋触性。其它范例如明暗箱测试以及捕食者逃避测试。
游泳模式
想要准确测量鱼在鱼缸中的位置，侧方和上方的观察视角都很重要。许多研究人员认为，速度的降低和运动的不规律也表明了鱼的焦虑和压力，这些参数手动测量起来有一定的困难，但是对于 视频跟踪软件(EthoVision XT) 来说这是一件容易的事。
深入的行为学见解
一些研究需要深入研究鱼类的游泳行为（例如，潜在的抗焦虑药物研究），这些研究面临的挑战是如何测量鱼在三维空间中的游泳行为。单独从侧面或俯视角度都无法获得对路径形状，不规则运动，甚至速度的完整准确评估。
对鱼类三维游泳模式的分析 可以提供有关化合物作用的详细信息。例如，在杜兰大学的Kalueff实验室（美国路易斯安那州新奥尔良）,研究人员发现,当检查来自已知抗焦虑药的不同作用时,3D跟踪显示出斑马鱼行为的差异更为明显。当观察仅限于平面视频跟踪时,甚至无法发现某些行为差异。
三维空间内的视频跟踪
为了分析三维空间中斑马鱼的游泳模式，您可以使用动物运动轨迹跟踪系统（EthoVision XT）中的三维运动轨迹跟踪系统（Track3D）附加组件。根据校准后的实验区域的俯视图和侧视图轨迹组合，系统能够可视化并分析鱼的完整游泳路径。它还可以帮助您计算许多其他运动参数。
参考文献
- Cachat, J.; Stewart, A.; Utterback, E.; Hart, P.; Gaikwad, S.; Wong, K.; Kyzar, E.; Wu, N.; Kalueff, A.V. (2011). Three-dimensional neurophenotyping of adult zebrafish behavior. PLoS ONE, 6(3), e17597.
- Stewart, A.M.; Grieco, F.; Tegelenbosch, R.A.J.; Kyzar, E.J.; Nguyen, M.; Kaluyeva, A.; Song, C.; Noldus, L.P.J.J.; Kalueff, A.V. (2015). A novel 3D method of locomotor analysis in adult zebrafish: implications for automated detection of CNS drug-evoked phenotypes. Journal of Neuroscience Methods, 255, 66-74.